Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPP1Q1MSJ5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms