Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSMPQ1L6U9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSMPQ1L6U9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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