Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IMPG1Q17R60 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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