Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPPQ16740 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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