Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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