Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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