Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms