Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CYTH1Q15438 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYTH1Q15438 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYTH1Q15438 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYTH1Q15438 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CYTH1Q15438 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms