Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPAQ15257 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms