Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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