Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD6Q15008 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms