Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM25Q14258 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms