Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTTNQ14247 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTTNQ14247 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms