Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EXOSC2Q13868 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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