Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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