Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP1A4Q13733 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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