Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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