Protein–RNA interactions for Protein: Q13433

SLC39A6, Zinc transporter ZIP6, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A6Q13433 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A6Q13433 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A6Q13433 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms