Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UBE2V1Q13404 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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