Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NR1H3Q13133 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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NR1H3Q13133 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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NR1H3Q13133 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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NR1H3Q13133 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NR1H3Q13133 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms