Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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TRAF3Q13114 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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