Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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IFT88Q13099 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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IFT88Q13099 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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IFT88Q13099 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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IFT88Q13099 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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