Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms