Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX10Q12887 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX10Q12887 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX10Q12887 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX10Q12887 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms