Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TWF1Q12792 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TWF1Q12792 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TWF1Q12792 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TWF1Q12792 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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TWF1Q12792 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TWF1Q12792 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TWF1Q12792 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TWF1Q12792 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TWF1Q12792 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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