Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLFN5Q08AF3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms