Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A11Q02978 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A11Q02978 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms