Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms