Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BNC1Q01954 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms