Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms