Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms