Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC42EP1Q00587 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC42EP1Q00587 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms