Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM3AP98173 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FAM3AP98173 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FAM3AP98173 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FAM3AP98173 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FAM3AP98173 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3AP98173 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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