Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMF1P82094 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMF1P82094 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMF1P82094 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMF1P82094 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMF1P82094 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms