Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIM1P81133 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SIM1P81133 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SIM1P81133 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms