Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX6P78412 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX6P78412 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX6P78412 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms