Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERVK_113P63121 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms