Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HERVK_113P61574 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms