Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTBP60709 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTBP60709 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTBP60709 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTBP60709 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms