Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms