Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL3P58872 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms