Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms