Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPTEP56180 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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