Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGGT1BP53609 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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