Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUCLG1P53597 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUCLG1P53597 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms