Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SMARCA2P51531 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms