Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DAP3P51398 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DAP3P51398 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DAP3P51398 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DAP3P51398 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DAP3P51398 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DAP3P51398 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms