Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK8P49336 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK8P49336 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK8P49336 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK8P49336 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK8P49336 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK8P49336 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK8P49336 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK8P49336 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK8P49336 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms