Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRATP43155 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRATP43155 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRATP43155 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRATP43155 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRATP43155 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms