Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6V1E1P36543 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms